Lentoyhtiö Aeroflotille on tapahtunut sen pitkän historian aikana lukuisia lento-onnettomuuksia. Yhteensä Aeroflot on menettänyt ainakin 627 lentokonetta onnettomuuksissa, joissa on kuollut ainakin 8 854 ihmistä. Näihin lukuihin on laskettu mukaan tässä luettelossa mainitut onnettomuudet. Useissa onnettomuuksissa kuolonuhrien määrä ei kuitenkaan ole tiedossa, joten luku on lähinnä suuntaa antava. Neuvostoliiton hajoamisen jälkeen Aeroflotin lentoturvallisuus on kuitenkin huomattavasti parantunut. Tästä on esimerkkinä Jet Airliner Crash Data Evaluation Centren vuoden 2014 turvallisimpien lentoyhtiöiden lista, jolla Aeroflot saavutti sijan 37. Taakse jäivät muun muassa Air France, American Airlines ja SAS.
Onnettomuuksien suuri määrä johtuu osaltaan siitä, että Aeroflot oli Neuvostoliiton aikana maailman suurin lentoyhtiö. Vuonna 1967 Aeroflotin laivasto oli kooltaan samaa luokkaa kuin Yhdysvaltojen suurimpien lentoyhtiöiden laivastot yhteensä. Vuonna 1990 Aeroflotin matkustajamailimäärä oli lähes 250 miljardia, hiukan vähemmän kuin American Airlinesilla, United Airlinesilla ja Delta Air Linesilla yhteensä. Neuvostoliiton romahduksen jälkeen Aeroflot pieneni kuitenkin huomattavasti, koska entisissä neuvostotasavalloissa toimineet Aeroflotin osastot muuttuivat itsenäistyvien maiden kansallisiksi lentoyhtiöiksi.
Toinen onnettomuuksien määrää selittävä asia on se, että Aeroflotin lentotoiminta oli länsimaisia lentoyhtiöitä huomattavasti laajempaa. Matkustajien ja rahdin lennättämisen lisäksi Aeroflot lennätti huoltokuljetuksia napa-alueilla sijaitseville tutkimusasemille, kriisi- ja sotatoimialueille, öljylautoille ja öljynporausalueille. Lisäksi Aeroflotin koneilla suoritettiin armeijan lentoja sekä pölytys- ja metsätalouslentoja. Tämän kaltaisessa lentotoiminnassa onnettomuusriskit ovat huomattavasti suuremmat.
Aeroflotille sattuneista onnettomuuksista kaikkein tuhoisin tapahtui 10. heinäkuuta 1985 Utškudukissa. Tupolev Tu-154B-2 syöksyi maahan miehistön virheen vuoksi ja 200 ihmistä kuoli. Kyseinen onnettomuus on myös pahin nykyisen Uzbekistanin alueella sattunut lento-onnettomuus ja pahin onnettomuus, jossa osallisena on ollut Tupolev Tu-154.
1930-luku 1930-luvulla Aeroflotille sattui yksi onnettomuus.
Päivämäärä Paikka Konetyyppi Rekisteri Aeroflotinosasto Uhrit/KoneessaolleetLyhyt kuvausViite Bistrița Douglas DC-2-152 CCCP-М25 ei tietoa ei tietoa Räjähti matkustajan sytytettyä savukkeen koneen WC:ssä, jonne oli kertynyt polttoainehöyryjä. Kaikki koneessa olleet kuolivat, mutta matkustajien määrää ei tiedetä.
1940-luku thumb|230px|Aeroflotin Tupolev ANT-20bis, joka tuhoutui Taškentissa vuonna 1942. 1940-luvulla Aeroflot menetti 25 konetta onnettomuuksissa, joissa kuoli 223 ihmistä. Vuosikymmenen pahin onnettomuus tapahtui 14. joulukuuta 1942 Taškentissa matkustajan otettua Tupolev ANT-20bis -koneen ohjaimet haltuunsa ja suljettua autopilotin, jolloin kone syöksyi maahan. Kaikki 36 koneessa ollutta kuolivat. Kyseinen onnettomuus on neljänneksi pahin nykyisen Uzbekistanin alueella sattunut onnettomuus.
Konetyypeittäin 1940-luvun menetykset jakautuvat seuraavasti:
9 kpl Lisunov Li-2 5 kpl Junkers Ju 52/3m 4 kpl Douglas C-47 4 kpl Iljušin Il-12 1 kpl Douglas DC-3 1 kpl Douglas TS-62 1 kpl Tupolev ANT-20
Päivämäärä Paikka Konetyyppi Rekisteri Aeroflotinosasto Uhrit/KoneessaolleetLyhyt kuvausViite Moskova Douglas DC-3-196A URSS-C ei tietoa Lentoonlähtö epäonnistui lumimyrskyssä. Taškent Tupolev ANT-20bis CCCP-Л760 ei tietoa Syöksyi maahan matkustajan otettua koneen ohjaimet ja suljettua autopilotin. Aša Junkers Ju 52/3m CCCP-Л37 ei tietoa Syöksyi maahan ja tuhoutui tulipalossa. Perevalovo Douglas C-47A CCCP-Л915 ei tietoa Konetta siirrettiin Ornetasta Tšernjahovskiin, kun se syöksyi maahan ja tuhoutui tulipalossa. Kone lensi liian matalalla ja toinen siipi osui puuhun. ei tietoa Junkers Ju 52/3m ei tietoa Turkmenistan Teki pakkolaskun moottorin hajottua. Taldi-Kurgan Junkers Ju 52/3m CCCP-Л26 Länsi-Siperia Uudelleenmoottoroitua konetta siirrettiin Almatysta Novosibirskiin, kun se törmäsi vuoreen ukkosmyrskyssä. Kazan Junkers Ju 52/3m CCCP-Л27 Moskova Teki pakkolaskun metsään moottoripalon takia. Moskova Douglas C-47 CCCP-Л946 ei tietoa Syöksyi maahan miehistön keskeytettyä lähestymisen ja nostettua konetta liian jyrkästi, jolloin nopeus laski liian alas. Moskova Lisunov Li-2 CCCP-Л4181 Turkmenistan Konetta siirrettiin Voronežista Moskovaan, kun se syöksyi maahan Moskovan liepeillä polttoaineen loputtua odotuskuviossa. Moskova Lisunov Li-2 CCCP-Л4207 Liettua Syöksyi maahan polttoaineen loputtua useiden lähestymisyritysten jälkeen. Mašhad Lisunov Li-2 ei tietoa ei tietoa 24 Syöksyi maahan. Volotšanka Douglas C-47-DL CCCP-Л1204 Krasnojarsk Teki pakkolaskun tundralle moottorin hajottua. Kaikki selvisivät pakkolaskusta, mutta yhdeksän kuoli etsiessään apua. Moskova Iljušin Il-12 CCCP-Л1317 Moskova Lentoonlähtö epäonnistui moottorin hajottua. Tšita Douglas C-47 CCCP-Л1215 Itä-Siperia Tuhoutui osuttuaan esteeseen yrittäessään pakkolaskua. ei tietoa Lisunov Li-2 CCCP-Л4437 Kaukoitä Ajautui kiitotieltä lentoonlähdössä. Siipi osui lennätinpylvääseen. Mamaktšana Lisunov Li-2 CCCP-Л4460 Itä-Siperia Juopunut miehistö eksyi huonossa säässä. He yrittivät seurata jokea, mutta menettivät korkeutta lumimyrskyssä ja kone putosi jokeen. Novosibirsk Iljušin Il-12 CCCP-Л1465 Moskova Tuhoutui pian lähdettyään Novosibirskista, kun lentoinsinööri vähensi moottoritehoja huomioimatta koneen nopeutta. Kone aloitti laskun, joka jatkui, kunnes kone osui maahan. Vasen siipi irtosi ja kone kääntyi 180 astetta. Potkurin lapa irtosi, läpäisi rungon ja tappoi yhden matkustajan. Yevlax Iljušin Il-12 CCCP-Л1450 Uzbekistan Kone yritti palata Bakuun radio- ja navigaatiovaikeuksien takia, kun se syöksyi maahan lähellä Yevlaxia. Kirensk Lisunov Li-2 CCCP-Л4658 Itä-Siperia Syöksyi maahan moottorien sammuttua saastuneen polttoaineen vuoksi. Samurskaja Lisunov Li-2 CCCP-Л4500 Georgia Miehistö eksyi ja kone törmäsi vuoreen. Kolyma Lisunov Li-2 CCCP-Л4463 Jakutia Kone teki pakkolaskun Kolymajoen jäälle ja upposi. Moskova Iljušin Il-12B CCCP-Л1731 Uzbekistan Törmäsi TS-62 -koneeseen. Il-12 menetti molemmat moottorit ja TS-62 -koneen pyrstöosa irtosi. Moskova Douglas TS-62 CCCP-Л861 Moskova Törmäsi Il-12 -koneeseen. Il-12 menetti molemmat moottorit ja TS-62 -koneen pyrstöosa irtosi. ei tietoa Junkers Ju 52/3m CCCP-Л54 Itä-Siperia Törmäsi vuoreen lumimyrskyssä. Kirensk Lisunov Li-2 CCCP-Л4464 Jakutia Ajautui 100 kilometriä sivuun reitiltä. Miehistö yritti saada maamerkkejä näkyviin vähentämällä korkeutta. Tämä ei onnistunut, vaan kone törmäsi vuoreen.
1950-luku pienoiskuva|Aeroflotin Iljušin Il-14. 1950-luvulla Aeroflot menetti 37 konetta onnettomuuksissa, joissa kuoli 589 ihmistä. Vuosikymmenen pahin onnettomuus tapahtui 17. lokakuuta 1958 Kanašissa, kun Tupolev Tu-104A -kone joutui voimakkaaseen nousuvirtaukseen, nousi liian korkealle, sakkasi ja syöksyi maahan. Kaikki 80 koneessa ollutta kuolivat. Onnettomuus oli tapahtuma-aikanaan pahin nykyisen Venäjän alueella sattunut lento-onnettomuus.
Konetyypeittäin 1950-luvun menetykset jakautuvat seuraavasti:
8 kpl Antonov An-2 8 kpl Iljušin Il-14 8 kpl Lisunov Li-2 6 kpl Iljušin Il-12 2 kpl Tupolev Tu-104 2 kpl konetyyppi ei tiedossa 1 kpl Antonov An-10 1 kpl Douglas TS-62 1 kpl Iljušin Il-18