thumb|275px|Yleisin uskonto asutuskeskuksittain vuonna 2002; muslimienemmistöiset asutuskeskukset vihreällä.
Islam on kahden miljoonan asukkaan Pohjois-Makedoniassa maan toiseksi suurin uskonto, jota harjoittaa noin 32–34 prosenttia väestöstä. Todellisen määrän on myös väitetty olevan paljon suurempi. Muslimeja ovat pääasiassa maan vähemmistökansallisuuksiin kuuluvat albaanit, turkkilaiset, romanit, bosniakit ja torbešit. Valtaosa muslimeista on sunneja. Muslimit asuvat useimmin maan pohjoisosissa sekä länsiosissa, missä albaanit ovat monin paikoin enemmistönä.
Muslimien keskuudessa on esiintynyt kiistaa moskeijoiden hallinnasta Balkanin perinteisten hanafi-muslimien ja puhdasoppisuutta vaativien salafistien välillä.
Makedonian konflikti 2001 Vuonna 2001 koettiin runsaat puoli vuotta kestänyt aseellinen konflikti Makedonian turvallisuusjoukkojen ja albanialaisten vapautusarmeijan välillä. Konflikti koski valtion poliittista ja kulttuurista luonnetta. Etniset makedonialaiset puolustivat makedonialaista kansallisvaltiota, kun taas albaanit vaativat itsemääräämisoikeutta sen sisällä. Konfliktilla oli myös uskonnollinen ulottuvuus, sillä albaanit olivat muslimeja ja makedonialaiset ortodoksikristittyjä. Ainakin yksi moskeija yritettiin konfliktin aikana polttaa.
Katso myös Islam Euroopassa Makedonian konflikti
Lähteet
Pohjois-Makedonia Luokka:Uskonto Pohjois-Makedoniassa