長岡統括センター（ながおかとうかつセンター）は、東日本旅客鉄道（JR東日本）新潟支社の駅・運転士・車掌を所管していた組織である。 2024年3月1日に長岡営業統括センター、長岡運輸区を統合して発足。2026年6月30日限りで新潟支社とともに廃止され、現在は長岡事業本部となっている（乗務員区所は対外的に「長岡乗務ベース」と呼称）。
所管 駅 長岡駅 - 所長所在駅 越後湯沢駅 ガーラ湯沢駅 浦佐駅 燕三条駅 上越妙高駅 柏崎駅 十日町駅 吉田駅 ※ 上記は直営駅（有人駅）のみ記載 信越本線 : 黒井駅 - 加茂駅間 上越線 : 土樽駅 - 宮内駅間 越後線 : 柏崎駅 - 巻駅間 弥彦線 : 全線 飯山線 : 足滝駅 - 越後川口駅間 只見線 : 大白川駅 - 小出駅間
乗務員 長岡駅構内に設置（旧長岡運輸区） 担当線区（運転士） 信越本線：直江津駅 - 新潟駅間 上越線：全線 只見線：只見駅 - 小出駅間 担当線区（車掌） 信越本線：直江津駅 - 新潟駅間 上越線：全線 越後線：全線 弥彦線：吉田駅 - 東三条駅間
歴史 2022年10月1日 - 長岡営業統括センター（長岡、越後湯沢、ガーラ湯沢、浦佐、燕三条、上越妙高、柏崎、十日町、吉田各駅の統合）が発足。 2024年3月1日 - 長岡営業統括センターに、長岡運輸区を統合し、長岡統括センター発足。長岡営業統括センター、長岡運輸区を廃止する。 2026年7月1日 - 新潟支社の廃止に伴い、羽生田駅・田上駅を新潟統括センターから移管を受け、上越妙高駅を長野事業本部に移管したうえで、長岡事業本部に改組。