マノクワリ県（マノクワリけん、）はインドネシア西パプア州の県。県都はマノクワリ。
行政 2010年の国勢調査ではマノクワリ県は29（Kecamatan）から構成されていたが、2013年にマノクワリ県の一部を分割して南マノクワリ県（Manokwari Selantan）、プグヌンガン・アルファク県（Pegunungan Arfak）が設立され、4地区がタンブラウ県に分割された。
マノクワリ県に残留した郡は9箇所であり、2010年の国勢調査による人口は以下のとおりであるBiro Pusat Statistik, Jakarta, 2011.。 名称 人口（2010年） Warmare 6,192 Prafi 14,240 Manokwari Barat 74,996 Manokwari Timur 8,988 Manokwari Utara 2,248 Manokwari Selatan 13,256 Tanah Rubuh 2,114 Masni 13,540 Sidey 4,390 合計 139,964
その他 分割前、県北部で石炭が確認されていたとされる。
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