Denne siden lister opp de gresk-ortodokse patriarkene av Jerusalem fra det store skisma mellom den katolske og den ortodokse kirke og frem til i dag. For patriarker før 1099 se liste over patriarker av Jerusalem.
Eksilpatriarker av Jerusalem (i Konstantinopel; 1099–1187) På grunn av korstogene og den romerske kirkens utnevnelse av en latinsk patriark av Jerusalem måtte den ortodokse patriarken av Jerusalem fra 1099 leve i eksil i Konstantinopel. Simeon II (1099–?) Johannes VIII (?–1106) Sabbas (1107–?) Nikolaos (?) Johannes IX (1156–1066) Nikeforos II (1166–1170) Leontios II (1171–?)
Patriarker i Jerusalem (1187–d.d.) Under Leontius II eller Dositheus I kunne patriarken flytte tilbake til Jerusalem. Dositheos I (?–1189) Markus II (1190–1195) Euthemius (1195–1223) Athanasios II (1224–1236) Sofronius III (1236–1272) Gregor I (1272–?) Thaddeos (rundt 1296) Sedisvakanse? Athanasios III (1313–1314) Sedisvakanse? Gabriel? (rundt 1320?) Gregor II (rund 1322?) Athanasios III (1322–1334) Lazaros (1334–1344) Arsenios (1344) Lazaros (1344–1368) Sedisvakanse? Dorotheos I (1376–1417) Theofilos II (1417–1424) Theofanes I (1424–1430) Joakim (?) Theophanes II (?) Athanasios IV (1452–?) Jakob II (?) Abraham I (?) Gregor III (1468–?) Sedisvakanse? Markus III (?–1503) Dorotheos II (1505–1537) Germanos I (1537–1579) Sofronios IV (1579–1608) Theofanes III (1608–1644) Paisios (1645–1660) Nektarios (1660–1669) Dositheos II (1669–1707) Khrysanthos (1707–1731) Meletios (1731–1737) Parthenios (1737–1766) Efraim II (1766–1771) Sofronios V (1771–1775) Abraham II (1775–1787) Prokopios I (1787–1788) Anthimos I (1788–1808) Polykarpos I (1808–1827) Athanasios V (1827–1845) Kyrillos II (1845–1872) Prokopios II (1872–1875) Hierotheos I (1875–1882) Nikodemos I (1883–1890) Gerasimos I (1890–1896) Damianos I (1897–1931) Topoteretes (1931–1935) Timotheos I (1935–1956) Benedikt I (1957–1980) Diodoros I (1981–2000) Ireneos I (2001–2005) Theofilos III (2005–)
! Jerusalem, ortodoks