Frankfurts universitet kan syfta på flera olika tyska universitet:
Frankfurt am Main Johann Wolfgang Goethe-Universität – ett universitet i Frankfurt am Main, grundat 1912 och öppnat 1914
Frankfurt an der Oder Alma Mater Viadrina – Brandenburgs första universitet, som mellan 1506 och 1811 låg i staden Frankfurt an der Oder Europa-Universität Viadrina – grundat 1991 i Frankfurt an der Oder.